Des chercheurs de Chine et d'Allemagne ont complètement déchiffré le génome de la pomme de terre pour la première fois, rapporte TASS. Cela les a aidés à démêler l'histoire évolutive de cette plante et à mettre en évidence les régions clés de l'ADN associées à la croissance et à la résistance aux maladies. Des informations à ce sujet ont été publiées par le service de presse de l'Institut allemand pour la sélection végétale (IPZ).
"Le séquençage du génome de la pomme de terre nous permettra de lancer des programmes de sélection performants qui créeront de nouvelles variétés à haut rendement mais résistantes au réchauffement climatique, ce qui sera critique dans les décennies à venir", a déclaré le professeur IPZ Korbinian Schneeberger.
De nombreuses maladies fongiques et bactériennes, ainsi que divers ravageurs tels que le doryphore de la pomme de terre et les nématodes, interfèrent avec la culture des pommes de terre. Les scientifiques et les sélectionneurs tentent de les combattre en créant de nouvelles variétés de pommes de terre conventionnelles et génétiquement modifiées.
Le professeur Schneeberger et ses collègues ont trouvé une solution potentielle à ce problème dans un projet massif visant à séquencer complètement le génome de la pomme de terre. Dans le passé, les scientifiques ont déjà tenté d'obtenir ces informations, mais cela a été entravé par la structure extrêmement complexe du génome de la pomme de terre - il se compose de quatre ensembles identiques de chromosomes contenant un grand nombre de répétitions.
Les nouvelles technologies de séquençage de l'ADN et les algorithmes d'analyse des informations génétiques ont aidé les généticiens allemands et chinois à résoudre ce problème pour la variété Otava. Pour déchiffrer le génome, les scientifiques ont collecté un grand nombre de grains de pollen, dont le matériel génétique ne contient que deux, et non quatre copies des chromosomes.
Cette approche simplifiait grandement la tâche, mais en même temps elle nécessitait le décodage d'un très grand nombre de fragments d'ADN et leur combinaison ultérieure à l'aide d'algorithmes informatiques. En fin de compte, les scientifiques ont obtenu une copie virtuelle du génome complet de la pomme de terre, qui se compose d'environ 3,1 milliards de "lettres" génétiques - nucléotides et contient plus de 38 XNUMX gènes.
L'analyse ultérieure de leur structure a révélé l'histoire évolutive complexe de la pomme de terre. Les scientifiques ont découvert que cette culture a relativement récemment survécu au doublement du génome résultant de la consanguinité. De plus, les scientifiques ont découvert des différences inhabituelles dans le niveau d'activité des copies des mêmes gènes situés sur différents chromosomes, affectant potentiellement l'efficacité du croisement de différentes variétés de pommes de terre.
Ces informations, espèrent les scientifiques, aideront à créer de nouvelles variétés ou à modifier le génome de manière à ce que les pommes de terre poussent plus vite, résistent mieux au mildiou et à d'autres maladies, et soient également moins sensibles à divers facteurs de stress.